Список категорий и номенклатуры я так понимаю в виде элементов контента лежат в kooboo?
И необходимо по запросу, например ID родителя, вернуть список дочерних элементов из папки контента, например, в виде JSON.
Самый простой вариант: сделать view, в котором написать запрос входного ID (по querystring например), получение элементов по ID из базы kooboo и вывод строки в виде JSON.
Далее создать пустой макет с одной место-позицией.
Создать страницу на основе пустого шаблона и добавить этот view.
Таким образом по заходу на адрес этой страницы дудет выдаваться JSON результат по ID, указанному в URL.
Теперь этот адрес можно использовать в AJAX-запросе.
Как-то так.
Пути посложнее - написать собственный модуль или плагин для этого.